Při změně způsobu uplatňování výdajů může nastat situace, kdy budete muset dodatečně zvýšit základ daně za předchozí rok, doplatit dlužnou daň a také úrok z prodlení. U každého podnikatele je to individuální, záleží na výši nespotřebovaných zásob, rezerv, pohledávek a závazků. Postup je upraven v § 23, odst. 8 zákona o daních z příjmů.