Zálohová faktura se vystavuje bez DPH, pokud je daň uvedena, pak pouze informativně, daňový doklad se vystavuje až ke dni přijetí zálohy.
V roce 2006 (platilo až do roku 2008) jste vůbec nesměla vystavit daňový doklad k přijaté záloze - přijetím zálohy se u osoby, která nevede účetnictví, neuskutečnilo zdanitelné plnění. Osoba nevedoucí účetnictví (vedla DE nebo uplatňovala výdaje procentem z příjmů) přiznávala daň na výstupu až ke dni uskutečnění zdanitelného plnění, většinou při vystavení konečné faktury.