Z pohledu DPH: pokud si neuplatníte nárok na odpočet daně při pořízení auta, tak při jeho trvalém vyřazení do osobního užívání nebudete muset tuto daň odvádět.
Z pohledu daně z příjmů: pokud auto zařadíte do obchodního majetku, tak si budete moci uplatnit ve výdajích veškeré výdaje, které budou s autem spojené, například opravy, pojištění, dálniční známku atd. a dále odpisy hmotného majetku. Pokud neuplatníte paušální výdaj na dopravu (ten se asi nevyplatí), tak povedete knihu jízd a budete uplatňovat prokázané výdaje na spotřebované PHM. Při vyřazení auto do osobního užívání nebudete odvádět daň z příjmů. Prodej auta z OM podléhá dani z příjmů (příjem z podnikání podle § 7 ZDP), prodej auta, které bylo zařazeno v OM a prodáte je do 5 let od vyřazení též podléhá dani z příjmů (příjem podle § 10 ZDP). Pokud auto nezařadíte do OM, tak si můžete uplatnit jen náhrady jízdních výdajů (základní sazbu náhrady 3,70 Kč/km + náhradu za spotřebované PHM). Prodej auta, které nebylo zařazeno v OM a prodáte je déle než po roce od pořízení, je osvobozen od daně z příjmů.