Ano, příloha 2 tak, jak píšete.
Částku 39 000,- Kč do výdajů nedostanete, žádný výdaj jste neuskutečnila.
To už je lepší auto ocenit reprodukční pořizovací cenou (zprůměrovat cenu, za kterou byste stejné auto koupila v nejbližších bazarech) a pokud cena překročí 40 tis. Kč, předpokládám, že ano, tak auto zařadit do hmotného majetku. No a dál se uvidí. Možná se vám některý rok hodí uplatnit jako výdaj odpis hmotného majetku, ale odpisovat nemusíte, je to vaše právo, nikoliv povinnost. Až budete chtít auto prodat, tak přijde další rozhodování. Bude prodejní cena auta nižší, než zůstatková? Pokud ano, tak nevyřazovat, ale prodat z OM. Vykážete příjem z podnikání (podle § 7 ZDP) a jako výdaj si uplatníte zůstatkovou cenu auta, ztráta z prodeje vám sníží základ daně z příjmů podle § 7 a také vyměřovací základy pro výpočet zdravotního a sociálního pojištění. Pokud prodáte za cenu vyšší, než je zůstatková (docílíte zisku z prodeje), pak je lepší auto před prodejem vyřadit z OM a přiznat příjem podle § 10 ZDP.
Co se týká DPH: majetek, při jehož pořízení jste neuplatnila nárok na odpočet, můžete beztrestně (bez odvodu DPH) vyřadit do osobního užívání. Pokud byste ale majetek prodávala přímo z OM, tak jeho prodej bude zatížen daní z přidané hodnoty.