Dobrý den, vzhledem k tomu, že mi zde prozatím nikdo neodpověděl a já už jsem zjistila odpověď, napíši ji zde pro případ, že by měl někdo stejný problém:
Uvedený případ řeší pokyn D 40 z r. 1993 (stále platný), kde se uvádí, že prodej standardního software, tzn. takového, kt. je určen pro širokou distribuci uživatelům je z hlediska daně z příjmu považován za prodej zboží nikoliv za licenci. Příjem zahraniční (v tomto případě kyperské) firmy není tedy považován za příjem se zdrojem na území ČR (a není tedy ani předmětem srážkové daně).