Vystavíte zálohovou fakturu, na které můžete, ale nemusíte uvést výši DPH. Zálohová faktura není daňovým dokladem, pouze jakousi žádostí o zaslání peněz předem. Do 15 dnů od přijetí zálohy byste měl vystavit daňový doklad k přijaté platbě (v idokladu nazváno jako příjmový pokladní nebo bankovní doklad), na kterém rozepíšete základ daně a daň ze zálohy. Předáte odběrateli, aby si mohl uplatnit nárok na odpočet. DD k přijaté platbě uvedete ve svém přiznání k DPH, protože máte povinnost přiznat daň na výstupu.
Až dokončíte práci, tak vystavíte konečnou vyúčtovací fakturu, ve které odečtete přijaté zálohy. DPH vypočítáte jen z doplatku, protože ze zálohy už máte přiznáno.